登瀛書院位於南投草屯西郊，正殿祀文昌帝君、朱子、魁星等，俗稱文昌祠。原油登瀛社社學改為義學，受白沙書院節制。乾隆年間，漢人入墾日漸增多，於北投街設置北投義學，以為漢人子弟啟蒙的場所。後道光十三年（西元1833年）南北投保、水沙連保等地紳士籌建書院，作為南、北投兩地漢人讀書的場所，起至即今『藍田書院』。但因藍田書院位於南投，北投保（今草屯）子弟就學頗為不便，故於到光二十七年（西元1847年）由北投保總理莊文蔚、職員紅濟純及生原洪鐘英等發起募捐，興建登瀛書院，餘道光二十八年（西元1848年）竣工完成。之後經過多次整修及九二一地震受創，於民國八十九年（西元2000年）進行災後整修，於民國九十二年（西元2003年）修護完成。

民國七十四年十一月二十七日，內政部頒佈「登瀛書院」為三級古蹟。